知识点

• Linux crontab：周期性执行程序
• R commandArgs 函数：传递R脚本参数
• R 批处理

Linux crontab 语法

Linux crontab是用来定期执行程序的命令。当安装完成操作系统之后，默认便会启动此任务调度命令。

crontab -l：查看当前的定时执行任务列表

crontab -e：进入vi命令模式，编辑定时任务，表达格式如下：

minute  hour  day  month  week  command

• minute：表示分钟，取值范围 0-59 的任何整数
• hour：表示小时，取值范围 0-23 的任何整数
• day：表示一个月中的第几天，取值范围 1-31 的任何整数
• month：表示月份，取值范围 1-12 的任何整数
• week：表示星期几，取值范围 0-7 的任何整数，星期天为0或者7
• command：表示要执行的命令；
• 星号（*）表示取值范围内的所有数字，如 minute 为 * 表示每分钟执行；
• 中杠（-）表示一个整数范围，如 minute 为 a-b 表示从第 a 分钟到第 b 分钟每分钟执行；
• 正斜杠（/n）表示每隔 n 长时间执行一次，如 minute 为 */n 表示每隔 n 分钟执行一次；
• 逗号（,）表示分隔开多个值，如 minute 为 a, b,... 表示第 a, b,... 分钟执行；

示例：

# 每小时的第5分钟执行一次
5 * * * * command
# 每小时的第5和35分钟执行一次
5,35 * * * * command
# 每天早上9:30执行一次
30 9 * * * * command
# 12月份每天早上6:00、9:00、12:00各执行一次
0 6-12/3 * 12 * command

crontab -r：删除定时任务（慎用！在任务前写#作为注释即可取消定时任务）

R commandArgs 函数

命令行传递的参数以向量的形式存储在commandArgs(TRUE) ，具体可通过 ?commandArgs 查看说明文档。

R 批处理

批处理：通俗讲地讲，就是编写R程序，然后通过命令方式执行。批处理模式运行R与使用的操作系统有关，以下是针对 Linux 系统。

R语言进行批处理有2种方式（推荐第一种，第二种无法传递参数，多数场景下都需要传递参数，比如日期）：

• /path/to/Rscript [–options] [-e expr [-e expr2 …] | file] [args] > outputfile
• R CMD BATCH [options] infile [outfile]

其中，options的选项以及含义如下：

• –slave：类似于–quiet,它禁止回送输入的信息，使R软件输出的信息更为简洁。
• –no-restore：在R启动时不还原工作空间。对于希望以空白工作空间启动R的脚本而言，这个选项很有必要。
• –no-save：在退出R时，不保存工作空间；否则，R会保存当前工作空间并覆盖原有工作目录中的.RData文件。
• –no-init-file：不读取.Rprofile文件或者~/. Rprofile文件。

示例演示

Step 1. 创建R脚本

argv <- commandArgs(TRUE)

if (length(argv) == 0) {
  beg_date <- end_date <- format(Sys.Date(), "%Y%m%d")
} else if (length(argv) == 1) {
  beg_date <- end_date <- argv[1]
} else {
  beg_date <- argv[1]
  end_date <- argv[2]
}

cat("开始日期：", beg_date, sep = "")
cat("\n")
cat("结束日期：", end_date, sep = "")
cat("\n")

Step 2. 命令行手动执行

$ Rscript /home/xxx/test.R                      # 不传入参数
开始日期：20201013
结束日期：20201013
$ 
$ Rscript /home/xxx/test.R 20220222             # 传入一个参数
开始日期：20200901
结束日期：20200901
$ 
$ Rscript /home/xxx/test.R 20220221 20220222    # 传入两个参数
开始日期：20200901
结束日期：20200902

Step 3. 通过crontab设置定时任务

1. 输入 crontab -e

2. 按 i，进入编辑模式，编辑定时任务

# 每天早上9:30后台执行R脚本
30 9 * * * Rscript /home/xxx/test.R > /home/xxx/test.log 2>&1 &

3. 按esc，退出编辑模式

4. 输入 :wq 后回车，设置定时任务完成

其中：

• 2>&1：表示将标准错误重定向到标准输出到log文件，日志保存便于排查问题；
• &：表示在后台运行；